第一套貸款結清二套房是否算首套要根據當地的房地產政策及貸款政策而定。

1、如果當地對購買第二套住房的政策是認房又認貸，那么第一套貸款結清后，再購買第二套住房仍然算作第二套住房。

2、如果當地對購買第二套住房的政策是認房不認貸，那么只要名下有房屋備案，不論是否有貸款、貸款是否結清，再購買第二套住房都算作第二套住房。

3、如果當地對購買第二套住房的政策是認貸不認房，那么只要還清首套房貸款，再購買第二套住房仍然算作首套房。

因此，具體情況需要咨詢當地的房地產部門或銀行，以確定具體的政策規(guī)定。

首套房二套房貸款的差異

1、貸款利率

二套房貸款的貸款利率是比首套房的貸款利率高不少的。就公積金貸款而言，二套房貸款的貸款利率，是要在首套房公積金貸款利率的基準上，上幅10%。其他商業(yè)貸款的二套房貸款利率，要以各商業(yè)銀行規(guī)定為準，但總體來說，都是比較高的。

2、貸款額度

二套房貸款的貸款額度比首套房的貸款額度低很多。具體的貸款額度，以地區(qū)規(guī)定為準。

3、貸款難度

當然，而二套房貸款的貸款難度，會比首套房貸款難度大很多，尤其是在遇到資金比較緊張的時候，二套房貸款往往很難申請到。

4、稅收優(yōu)惠政策不同

一套和二套在交易上，一套有契稅優(yōu)惠(普通且90平米以下按1%征收，普通按1.5%征收，非普通還是3%)，二套無論什么情況契稅都是3%。在房產稅上，一套免征，二套按家庭人均60平米計算，超過部分征收房產稅，每年年底繳清，稅率為非普通住宅0.6%，普通住宅0.4%，標地按合同價的70%計征。