1、三峽水庫會造成生態(tài)環(huán)境惡化，水力發(fā)電本身或許不會直接造成污染，修建大壩、利用水力發(fā)電，不僅有可能造成新的污染源，而且還會把一些可貴的、可再利用的資源變成瀕危資源或使之滅絕；

2、三峽水庫淤積構(gòu)成嚴(yán)重威脅，三峽淤積的危害不是泥沙，而是礫卵石，原來年年排出夔門的礫卵石將排不出去，可能10年內(nèi)就堵塞重慶港，并向上游逐年延伸，汛期淹沒江津、合川一帶；

3、三峽工程會使長江水域通航困難；

4、三峽工程會誘發(fā)各種地質(zhì)災(zāi)害，三峽工程蓄水后，導(dǎo)致震源很淺的巖溶塌陷和庫岸調(diào)整。