沈陽藥科大學高等職業(yè)技術學院是藥科大學的二級學院。學院位于鐵西區(qū)北一西路，占地面積為2萬多平方米，建筑面積1萬多平方米。學院現有教職工人數169人。其中專任教師73人；教授、副教授33人；中級職稱及以下40人。研究生17人，碩士在讀19人，博士在讀3人。教輔14人，圖書情報人員10人，輔導員教師10人。其余為行政管理人員及工人。

沈陽藥科大學高等職業(yè)技術學院，由原遼寧省醫(yī)療器械學校演變而來。學院分為藥學系、醫(yī)療器械系、基礎部二系一部和一個實訓教學中心。設有11個專業(yè)：醫(yī)用電子儀器與維護、醫(yī)療器械制造與維護、藥物制劑技術、藥學、藥物分析、電子商務、生物制藥、藥品經營與管理、制藥設備維修技術、中藥制藥技術、中藥應用技術，有13個教研室。