昆明航空于2007年2月25日獲得中國(guó)民航局批準(zhǔn)籌建，2009年1月獲得《公共航空運(yùn)輸企業(yè)經(jīng)營(yíng)許可證》，主要經(jīng)營(yíng)航空客貨運(yùn)輸業(yè)務(wù)，主基地設(shè)在昆明。 昆明航空公司以昆明長(zhǎng)水國(guó)際機(jī)場(chǎng)作為自己的基地機(jī)場(chǎng)，主要經(jīng)營(yíng)范圍是國(guó)內(nèi)支線航空客貨運(yùn)輸業(yè)務(wù)。

2020年10月，被評(píng)為全國(guó)交通運(yùn)輸系統(tǒng)抗擊新冠肺炎疫情先進(jìn)集體。